生产有机肥料的原料大多是农业废弃物，如畜禽粪便等，在生产有机肥料的过程中，如果处理不当，会给生态环境造成二次污染，在有机肥料建厂的选址、规划设计、原料选择、工艺确定等方面应足够重视。
1）原料的确定
依据因地制宜，就地取材的原则选取有机肥生产原料。原料的运输半径在100公里以内为宜，尽量不要出现运费比原料贵的情况。因为有机肥料的生产本身就是废弃物利用，售价并不高。所以中间的费用不能太高。否则，将失去市场竞争力。
在确定生产有机肥料之前，一定要考虑原料数量是否足够，原料的价格是否昂贵，原料呢狗持续供应因素。如果原料未自己养殖场废弃物。则无需额外开支购买原料。
2）厂址选择
有机肥生产原料在运输和发酵过程中，或多或少会产生一些特殊气味。因此，有机肥厂的选址要掌握以下原则：（1）原理居民区，原理工业区，避免对周围居民及其他生产厂家造成反感。（2）靠近原料场地，以减少运输费用和运输污染。（3）交通相对方便。（4）供水供电方便。
有机肥厂的建设同样具备因地制宜的原则。在依据自身条件的基础上，企业主可以充分发挥自己能力，合理建设肥料厂。有机肥的场地建设一般具有以下特点：
（1）办公区尽量远离发酵场地，且办公区应在上风位置。
（2）发酵原料进厂通道应独立且偏僻，与企业主通道分开。（发酵原料有可能是粪便，臭源整天进出工厂大门，很不合适。）
（3）原料区-发酵厂区-半成品陈化趋-深加工区-成品区，应具有连续性，间隔不远。
有机肥厂场地规划
4）工艺和设备的选择
工艺和设备由投资规模来确定，也与生产原料有密切关系。生产工艺应考虑利于短平快做出成品为宜。不是越负责，投资越大越好。确定生产工艺和设备要多听技术人员的建议，这样可避免走弯路，浪费物力人力。
