我们都知道有机肥加工厂为了减不必要的成本，一般会选择自己堆肥，然而堆肥会增加土地面积，同时还会产生大量的臭气污染。
因此，有机肥加工厂的选址因素中，交通情况就显得十分重要，需要使得堆肥的储藏和运输费用降至最低。这就引出一个问题：集中方案是否比分散方案更好？
经济学观点认为，尽管分散方案交通方面的花费较少，但集中方案总是相对便宜。因为通往商业区和工业区的道路大多很宽，所以收集生活垃圾的车辆可以与其余车辆一同行驶。而运货车通常要比垃圾收集车大很多，因此堆肥工厂的交通运输需求要小于邮政运输。但是垃圾收集车设计不当会导致运输过程中散发恶臭，并留下污水。
所以在考虑建有机肥加工厂选址问题时，应考虑以下因素：
1、生态有机肥厂距离村庄应在2公里以上，并且处于村子的下风口。这是因为粪便本身就属于农业废弃物，在发酵和运输过程中，难免产生一些难闻的气味，位于下封口且里村民生活区较远，对于老百姓的生活影响不大。
2、粪便等发酵原料的运输，不要横穿村庄，省道或国道一般没什么问题。尤其在白天的时候，拉粪车经过乡间小道和村庄，会给村民带来令人厌恶的气味，长此以往，必然引来村民公愤。
3、有机肥厂一般建设在比较生僻的地方，或者工业区内，这样注册公司、立项、办理环境污染评价手续时，比较容易。
4、由于大多工业区不和铁路相连，所以运输和销售产品主要通过卡车或集装箱运输车。而城镇边缘区域交通压力较小，所以选址时应选择靠近城郊高速公路的位置，这样运输比较方便。
5、在森林或原始景观区选址会破坏自然环境，最好加以避免。在乡村选址应靠近农舍、农业建筑或温室，厂房的大小应与周围环境统一。
