肥料厂应修建在地势高燥、平坦，排水良好的地方，场地面积可根据管理方式、生产率、厂房（包括加工车间、发酵车间、原料库、成品库）布置等来确定，要求布局紧凑，合理。
作为一个能正常运行的肥料厂，水源和电源必须能够正常供应，发酵车间的水分调质和和加工车间的造粒都需要有充足定制的水源供应。为满足生产加工要求，成套加工设备和部分单机设备还需要稳定的电源。
公共关系是指肥料厂与周围社会的联系。如与居民区的联系，交通和电力的供应等。因此，肥料厂的选址必须遵守社会公共卫生标准，使肥料厂不致成为周围环境的污染源，同时也不受周围环境的污染。因此肥料厂应距居民2000以外的下风向。同时考虑到肥料的销售、加工，肥料厂应建在离市区不远处，交便利的城镇郊区为宜。
合理的生产规模一般来讲，有机肥厂由于有机质发酵需要一定的周期，所以有机肥厂的占地规模和投资相对较大。
适当的自动化程度通常情况有机肥厂工厂条件艰苦、劳动强度大，生产过程应提高自动化程度，以减轻劳动强度、改善工况降低用工成本。但过分地追求高自动化会引起运行成本的升高。因此，因根据市场情况，资金实力选择适当的自动化程度，不应片面追求高自动化会引起运行成本的升高。因此，应根据市场情况、资金实力选择适当的自动化程度，不应片面追求高自动化。
合理处理有机质原料进行科学合理的处理任何设备对其加工对象都有一定的适宜性，有机质发酵有一定的条件要求，所以有机肥加工设备对其料也有一定的要求。有机肥原料来源广泛，不用的原料性质差别较大。为了保证加工过程中设备的正常工作，我们也要对有机质原料进行科学合理的处理，使其达到设备所要求的加工条件。
